Back to site

Karg Koti

Source: http://karg.cbi.pku.edu.cn/


Chuan-Yun Li, Xizeng Mao, Liping Wei, Genes and (Common) Pathways Underlying Drug Addiction, Plos Computational Biology, 2008, Jan 4;4(1):e2


Pohjalta käsin integroida 2343 eriä cross-platform data yhdistää geenien ja kromosomi alueiden riippuvuuden vertaisarvioituja julkaisuja vuosina 1976 ja 2006, luettelo 1500 riippuvuuksiin liittyviä ihmisen geenien havaittiin myös tutkimuksessa. Niistä 396 geeniä tukivat kaksi tai useampia seikkoja. Voit mainita tässä työssä, katso: Li CY, Mao X, Wei L (2008) Geenit ja (yleinen) reittejä taustalla huumeriippuvuutta. PLoS las Biol 4 (1): e2. doi: 10.1371/journal.pcbi.0040002

 Tietoja Addiction

 

Drug Addiction on tullut yksi suurimmista ongelmista maailmassa. On arvioitu, että geneettiset tekijät vaikuttavat 40% -60%: n haavoittuvuuden huumeriippuvuuden ja ympäristötekijät antaa loput. Mitä geenit ja reitit addiktion? Onko yhteinen MegNet addiktion eri väärin aineita? Onko verkon ominaisuus, joka voi selittää pitkäikäisiä ja usein peruuttamattomia molekyyli-ja rakennemuutokset jälkeen riippuvuus? Nämä tärkeät kysymykset ovat perinteisesti tutkittu kokeellisesti. Räjähdys genomin ja proteomic tietoja viime vuosina sekä otettu käyttöön ja edellytti bioinformatiikan opintoja riippuvuuden.

 Tietoja Karg

 

 http://karg.cbi.pku.edu.cn/site_map.png

Tervetuloa Karg: Knowledgebase for Addiction liittyviä geenejä.

Karg tavoitteena on yhdistää useita analyysi strategioita huumeriippuvuus korvaamaan ennakkoluuloja, jotka vaikuttavat jokaisen strategian. Ja tietoja yhdistämällä geenien ja kromosomi alueiden riippuvuus oli kopioitu läpi yli 1000 vertaisarvioituja julkaisuja vuosien 1976 ja 2006. Tämä julkaisuluettelo mukana äskettäisen tarkistuksen kirjoituksia riippuvuuteen valitaan tuloksista PubMed query ("riippuvuus tai" huumeiden käyttö) "JA tarkastelu" sekä tutkielmia valitaan PubMed query" (riippuvuus tai "huumeiden käyttö") JA (geeni OR microarray TAI proteomiikka TAI QTL TAI "väestö yhdistys" tai "geneettisen kytkennän"). Tietojen jakautuivat eri teknologia-alustoista, kuten klassista hypoteesia testausta yksittäisten geenien tunnistaminen merkittävästi eri tavoin ilmaistuna geenejä microarray kokeiluja, tunnistamista merkittävästi eri tavoin ilmaistuna proteiineja proteomiikka kokeissa tunnistaminen riippuvuuden haavoittuvien kromosomialueita eläinten QTL tutkimuksissa geneettisen kytkennän tutkimukset, väestö yhdistyksen tutkimuksia ja OMIM huomautuksia. Jokaisesta julkaisu keräsimme geenien, proteiinien tai kromosomialueita liittyviä riippuvuutta, sekä metatiedot kuten laji, luonne riippuvuutta aiheuttavan aineen tutkittu aivojen alueilla, teknologia-alustoja, ja kokeellisia parametreja. Yhteensä keräsimme 2343 todisteita yhdistää 1500 ihmisgeenejä riippuvuuteen. Niistä 396 geeniä tukivat kaksi tai useampia seikkoja.

Karg käyttöliittymä tukee selaaminen geenien kromosomi tai väyliä, kehittyneet tekstihaku geenitekniikan ID, organismi, tyyppi riippuvuutta aineen, teknologia-alustan, proteiinia toimialueen ja/tai PubMed tunnus ja järjestys hakua BLAST samankaltaisuus. Kaikki tiedot, tietokantakaavaa ja MySQL komennot ovat vapaasti ladattavissa lataussivustostamme:

 http://karg.cbi.pku.edu.cn/download.php

Napsauta kaavion ottaa luonnonkaunis kiertueen yksi sovellusten

 

 Uutiset

 

 

15 lokakuu 2011: Karg 2.0, "Meta-analyysi ja genominlaajuisten tulkinnan geneettinen alttius huumeriippuvuuden", on hyväksynyt BMC Genomics. (ks. linkit)

2 tammikuu 2010: Karg ryhmä tunnistettu ensimmäinen ihminen-proteiini-koodaavan geenin, jonka alkuperä kautta de novo evoluution. Työ on hyväksynyt PLoS Computational Biology. (ks. linkit)

02 maaliskuu 2008: NIDA/NIH (National Institute on Drug Abuse, National Institutes of Health) lisätään linkki Karg niiden verkkosivuilla. (ks. linkit)

05 helmikuu 2008: Karg oli esillä on Science (STKE) kuin "Editors Choice": "Bioinformatics lähestymistapa Addiction". (katso kommentti)

10 tammikuu 2008: Karg kommentoi by Economist (sekä painetussa että online-versio):

 "Ryhmä kiinalaisia ​​tutkijoita on löytänyt tärkein biokemiallisia reittejä huumeriippuvuuden ja ilman tehdä yhden kokeen". (katso kommentti)

25 tammikuu 2008: Karg sai kommentoi Kiinan lehden Science. (katso kommentti)

14 tammikuu 2008: Karg kommentoi by Kiina Daily: "Geenit takana huumeriippuvuuden seurataan". (katso kommentti)

08 tammikuu 2008: Karg kommentoi by REUTERS: "Huumeriippuvuus geenit tunnistettu". (katso kommentti)

04 tammikuu 2008: Public Library of Science (PLoS) julkaisi lehdistötiedotteen kommentoida Karg, joka on nopeasti julkaissut yli 30 sivustoja."Kokoaminen palapeli Drug Addiction". (katso kommentti)

19 joulukuu 2007: Karg korostui Nature Kiina: "Huumeriippuvuus: lopullinen geeni lista". (katso kommentti)

04 tammikuu 2008: Karg on julkaistu PLoS Computational Biology:

 Li CY, Mao X, Wei L (2008) Geenit ja (yleinen) reittejä taustalla huumeriippuvuutta. PLoS tietokoneiden Biol 4 (1): e2. doi: 10.1371/journal.pcbi.0040002 (PubMed) (Full Text)

11 lokakuu 2007: Karg jätettiin PLoS Computational Biology.

01 tammikuu 2007: Karg 1,0 data jäätyä. yhteensä 1500 ihmisen geeneistä liittyi riippuvuuden kanssa 2343 itsenäinen todisteita.

01 marraskuu 2005: Karg käynnistynyt Center for Bioinformatics, Pekingin yliopisto.

 Center for Bioinformatics (CBI), Pekingin yliopisto. Kommentteja ja ehdotuksia: Karg GROUP

translated by OL
Published (Last edited): Apr 22